Evaluation of QuickFISH and maldi Sepsityper for identification of bacteria in bloodstream infection

Abstract:
Abstract Background: Early detection of bacteria and their antibiotic susceptibility patterns are critical to guide therapeutic decision-making for optimal care of septic patients. The current gold standard, blood culturing followed by subculture on agar plates for subsequent identification, is too slow leading to excessive use of broad-spectrum antibiotic with harmful consequences for the patient and, in the long run, the public health. The aim of the present study was to assess the performance of two commercial assays, QuickFISH® (OpGen) and Maldi Sepsityper™ (Bruker Daltonics) for early and accurate identification of microorganisms directly from positive blood cultures. Materials and methods: During two substudies of positive blood cultures, the two commercial assays were assessed against the routine method used at the clinical microbiology laboratory, Unilabs AB, at Skaraborg Hospital, Sweden. Results: The Maldi Sepsityper™ assay enabled earlier microorganism identification. Using the cut-off for definite species identification according to the reference method (>2.0), sufficiently accurate species identification was achieved, but only among Gram-negative bacteria. The QuickFISH® assay was time-saving and showed high concordance with the reference method, 94.8% (95% CI 88.4–98.3), when the causative agent was covered by the QuickFISH® assay. Conclusions: The use of the commercial assays may shorten the time to identification of causative agents in bloodstream infections and can be a good complement to the current clinical routine diagnostics. Nevertheless, the performance of the commercial assays is considerably affected by the characteristics of the causative agents.
Author Listing: Helena Enroth;Karolina Retz;Sofie Andersson;Carl Andersson;Kristina Svensson;Lars Ljungström;Diana Tilevik;Anna-Karin Pernestig
Volume: 51
Pages: 249 - 258
DOI: 10.1080/23744235.2018.1554258
Language: English
Journal: Infectious Diseases

Infectious Diseases

INFECT DIS-NOR

影响因子:4.0 是否综述期刊:否 是否OA:否 是否预警:不在预警名单内 发行时间:- ISSN:2374-4235 发刊频率:- 收录数据库:SCIE/Scopus收录/DOAJ开放期刊 出版国家/地区:NORWAY 出版社:Taylor and Francis Ltd.

期刊介绍

Infectious Diseases (formerly Scandinavian Journal of Infectious Diseases) is a peer-reviewed journal publishing articles on all aspects of human infection, including pathogenesis, diagnosis, and treatment of infectious diseases, and also on medical microbiology and epidemiology

《传染病》(前身为《斯堪的纳维亚传染病杂志》)是一份同行评审期刊,发表有关人类感染的所有方面的文章,包括传染病的发病机制、诊断和治疗,以及医学微生物学和流行病学

年发文量 97
国人发稿量 4
国人发文占比 4.12%
自引率 0.0%
平均录取率 -
平均审稿周期 8 Weeks
版面费 -
偏重研究方向 INFECTIOUS DISEASES-
期刊官网 http://www.tandfonline.com/loi/infd20
投稿链接 https://mc.manuscriptcentral.com/sinf

质量指标占比

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期刊预警不是论文评价,更不是否定预警期刊发表的每项成果。《国际期刊预警名单(试行)》旨在提醒科研人员审慎选择成果发表平台、提示出版机构强化期刊质量管理。

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JCR分区 WOS分区等级:Q2区

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WOS期刊SCI分区
WOS期刊SCI分区是指SCI官方(Web of Science)为每个学科内的期刊按照IF数值排 序,将期刊按照四等分的方法划分的Q1-Q4等级,Q1代表质量最高,即常说的1区期刊。
(2021-2022年最新版)
INFECTIOUS DISEASES Q2

关于2019年中科院分区升级版(试行)

分区表升级版(试行)旨在解决期刊学科体系划分与学科发展以及融合趋势的不相容问题。由于学科交叉在当代科研活动的趋势愈发显著,学科体系构建容易引发争议。为了打破学科体系给期刊评价带来的桎梏,“升级版方案”首先构建了论文层级的主题体系,然后分别计算每篇论文在所属主题的影响力,最后汇总各期刊每篇论文分值,得到“期刊超越指数”,作为分区依据。

分区表升级版(试行)的优势:一是论文层级的主题体系既能体现学科交叉特点,又可以精准揭示期刊载文的多学科性;二是采用“期刊超越指数”替代影响因子指标,解决了影响因子数学性质缺陷对评价结果的干扰。整体而言,分区表升级版(试行)突破了期刊评价中学科体系构建、评价指标选择等瓶颈问题,能够更为全面地揭示学术期刊的影响力,为科研评价“去四唯”提供解决思路。相关研究成果经过国际同行的认可,已经发表在科学计量学领域国际重要期刊。

《2019年中国科学院文献情报中心期刊分区表升级版(试行)》首次将社会科学引文数据库(SSCI)期刊纳入到分区评估中。升级版分区表(试行)设置了包括自然科学和社会科学在内的18个大类学科。基础版和升级版(试行)将过渡共存三年时间,推测在此期间各大高校和科研院所仍可能会以基础版为考核参考标准。 提示:中科院分区官方微信公众号“fenqubiao”仅提供基础版数据查询,暂无升级版数据,请注意区分。

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医学
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