A series of three cases of severe Clostridium difficile infection in Australia associated with a binary toxin producing clade 2 ribotype 251 strain.

Abstract:
Three patients with severe Clostridium difficile infection (CDI) caused by an unusual strain of C.\xa0difficile, PCR ribotype (RT) 251, were identified in New South Wales, Australia. All cases presented with severe diarrhoea, two had multiple recurrences and one died following a colectomy. C.\xa0difficile RT251 strains were isolated by toxigenic culture. Genetic characterisation was performed using techniques including toxin gene profiling, PCR ribotyping, whole genome sequencing (WGS), in-silico multi-locus-sequence-typing (MLST) and core-genome single nucleotide variant (SNV) analyses. Antimicrobial susceptibility was determined using an agar incorporation method. In\xa0vitro toxin production was confirmed by Vero cell cytotoxicity assay and pathogenicity was assessed in a murine model of CDI. All RT251 isolates contained toxin A (tcdA), toxin B (tcdB) and binary toxin (cdtA and cdtB) genes. Core-genome analyses revealed the RT251 strains were clonal, with 0-5 SNVs between isolates. WGS and MLST clustered RT251 in the same evolutionary clade (clade 2) as RT027. Despite comparatively lower levels of in\xa0vitro toxin production, in the murine model RT251 infection resembled RT027 infection. Mice showed marked weight loss, severe disease within 48\u202fh post-infection and death. All isolates were susceptible to metronidazole and vancomycin. Our observations suggest C.\xa0difficile RT251 causes severe disease and emphasise the importance of ongoing surveillance for new and emerging strains of C.\xa0difficile with enhanced virulence.
Author Listing: Michael C Wehrhahn;Caitlin Keighley;Jelica Kurtovic;Daniel R Knight;Stacey Hong;Melanie L Hutton;Dena Lyras;Qinning Wang;Rupert Leong;Tom Borody;Michael Edye;Thomas V Riley
Volume: 55
Pages: \n 117-123\n
DOI: 10.1016/j.anaerobe.2018.11.009
Language: English
Journal: Anaerobe

ANAEROBE

ANAEROBE

影响因子:2.5 是否综述期刊:否 是否OA:否 是否预警:不在预警名单内 发行时间:1995 ISSN:1075-9964 发刊频率:Bimonthly 收录数据库:SCIE/Scopus收录 出版国家/地区:ENGLAND 出版社:Academic Press Inc.

期刊介绍

Anaerobe is essential reading for those who wish to remain at the forefront of discoveries relating to life processes of strictly anaerobes. The journal is multi-disciplinary, and provides a unique forum for those investigating anaerobic organisms that cause infections in humans and animals, as well as anaerobes that play roles in microbiomes or environmental processes.Anaerobe publishes reviews, mini reviews, original research articles, notes and case reports. Relevant topics fall into the broad categories of anaerobes in human and animal diseases, anaerobes in the microbiome, anaerobes in the environment, diagnosis of anaerobes in clinical microbiology laboratories, molecular biology, genetics, pathogenesis, toxins and antibiotic susceptibility of anaerobic bacteria.

厌氧菌是必不可少的阅读那些谁希望保持在前沿的发现有关的生命过程严格厌氧菌。该杂志是多学科的,为研究引起人类和动物感染的厌氧微生物以及在微生物群或环境过程中发挥作用的厌氧微生物提供了一个独特的论坛。Anaerobe发表评论,迷你评论,原创研究文章,笔记和病例报告。相关主题包括人类和动物疾病中的厌氧菌、微生物组中的厌氧菌、环境中的厌氧菌、临床微生物学实验室中厌氧菌的诊断、分子生物学、遗传学、致病机理、厌氧菌的毒素和抗生素敏感性。

年发文量 82
国人发稿量 6
国人发文占比 7.32%
自引率 8.0%
平均录取率 较易
平均审稿周期 平均3.0个月平均8.8周
版面费 US$3080
偏重研究方向 生物-微生物学
期刊官网 http://www.journals.elsevier.com/anaerobe/
投稿链接 https://www.editorialmanager.com/ANAEROBE

质量指标占比

研究类文章占比 OA被引用占比 撤稿占比 出版后修正文章占比
91.25% 20.67% 0.00% 0.00%

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期刊预警不是论文评价,更不是否定预警期刊发表的每项成果。《国际期刊预警名单(试行)》旨在提醒科研人员审慎选择成果发表平台、提示出版机构强化期刊质量管理。

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WOS期刊SCI分区是指SCI官方(Web of Science)为每个学科内的期刊按照IF数值排 序,将期刊按照四等分的方法划分的Q1-Q4等级,Q1代表质量最高,即常说的1区期刊。
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关于2019年中科院分区升级版(试行)

分区表升级版(试行)旨在解决期刊学科体系划分与学科发展以及融合趋势的不相容问题。由于学科交叉在当代科研活动的趋势愈发显著,学科体系构建容易引发争议。为了打破学科体系给期刊评价带来的桎梏,“升级版方案”首先构建了论文层级的主题体系,然后分别计算每篇论文在所属主题的影响力,最后汇总各期刊每篇论文分值,得到“期刊超越指数”,作为分区依据。

分区表升级版(试行)的优势:一是论文层级的主题体系既能体现学科交叉特点,又可以精准揭示期刊载文的多学科性;二是采用“期刊超越指数”替代影响因子指标,解决了影响因子数学性质缺陷对评价结果的干扰。整体而言,分区表升级版(试行)突破了期刊评价中学科体系构建、评价指标选择等瓶颈问题,能够更为全面地揭示学术期刊的影响力,为科研评价“去四唯”提供解决思路。相关研究成果经过国际同行的认可,已经发表在科学计量学领域国际重要期刊。

《2019年中国科学院文献情报中心期刊分区表升级版(试行)》首次将社会科学引文数据库(SSCI)期刊纳入到分区评估中。升级版分区表(试行)设置了包括自然科学和社会科学在内的18个大类学科。基础版和升级版(试行)将过渡共存三年时间,推测在此期间各大高校和科研院所仍可能会以基础版为考核参考标准。 提示:中科院分区官方微信公众号“fenqubiao”仅提供基础版数据查询,暂无升级版数据,请注意区分。

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