Alternative eradication regimens for Helicobacter pylori infection in Indonesian regions with high metronidazole and levofloxacin resistance

Abstract:
Background The prevalence of Helicobacter pylori resistance to metronidazole and clarithromycin is high in Indonesia. Moreover, the increasing levofloxacin resistance rates in the absence of bismuth treatment in Indonesia has led to the use of other antibiotics as alternative regimens. Methods We determined the minimum inhibitory concentrations (MICs) of five alternative antibiotics for H. pylori (rifaximin, rifabutin, furazolidone, garenoxacin, and sitafloxacin) using the agar dilution method and assessed mutations associated with antibiotic resistance using next-generation sequencing. Result Analysis of 106 strains isolated from 1039 adult dyspeptic patients revealed that none of the strains were furazolidone-resistant. All strains were also sensitive to rifabutin and sitafloxacin. In contrast, the rates of resistance to rifaximin and garenoxacin were high (38.9% and 6.7%, respectively). The strains isolated from patients on Java Island had the highest resistance rates to garenoxacin and rifaximin. In addition, the resistance was distributed evenly among the ethnic groups, ranging between 25.0% and 69.2%. Except for rifaximin, for which the resistance rate was 38.9%, the other four antibiotics could be successfully employed to eradicate levofloxacin- and metronidazole-resistant H. pylori infections in vitro. Interestingly, garenoxacin-sensitive strains were found in regions with high clarithromycin resistance rates such as Bali and Papua Islands. In contrast, rifaximin might not be considered as an alternative antibiotic in regions with high clarithromycin resistance. There was an inconsistent association between gyrA and gyrB mutations and garenoxacin resistance. We confirmed that the I837V (replacement of isoleucine at position 837 with valine), A2414T/V, Q2079K and K2068R were the predominant rpoB point mutations. There was an association between vacA genotypes of H. pylori and rifaximin resistance (P = 0.048). Conclusion furazolidone-, rifabutin-, and sitafloxacin-based therapies might be considered as alternative regimens to eradicate H. pylori in Indonesia, including regions with high metronidazole and clarithromycin resistance rates. Moreover, sitafloxacin but not garenoxacin should be considered for eradication of levofloxacin-resistant strains.
Author Listing: Muhammad Miftahussurur;Langgeng Agung Waskito;Ari Fahrial Syam;Iswan Abbas Nusi;Gontar Siregar;Marselino Richardo;Achmad Fuad Bakry;Yudith Annisa Ayu Rezkitha;I Dewa Nyoman Wibawa;Yoshio Yamaoka
Volume: 12
Pages: 345 - 358
DOI: 10.2147/IDR.S187063
Language: English
Journal: Infection and Drug Resistance

Infection and Drug Resistance

INFECT DRUG RESIST

影响因子:2.9 是否综述期刊:否 是否OA:是 是否预警:不在预警名单内 发行时间:- ISSN:1178-6973 发刊频率:- 收录数据库:SCIE/Scopus收录/DOAJ开放期刊 出版国家/地区:UNITED STATES 出版社:Dove Medical Press Ltd.

期刊介绍

About Journal Editors Peer Reviewers Articles Article Publishing Charges Aims and Scope Call For PapersISSN: 1178-6973Editor-in-Chief: Professor Suresh AntonyAn international, peer-reviewed, open access journal that focuses on the optimal treatment of infection (bacterial, fungal and viral) and the development and institution of preventative strategies to minimize the development and spread of resistance.

关于期刊编辑同行评审文章文章出版收费目标和范围呼吁论文ISSN:1178- 6973主编:Suresh Antony教授一本国际性、同行评审、开放获取的期刊,重点关注感染(细菌、真菌和病毒)的最佳治疗以及预防策略的开发和制度,以尽量减少耐药性的发展和传播。

年发文量 682
国人发稿量 466
国人发文占比 68.33%
自引率 6.9%
平均录取率 -
平均审稿周期 16 Weeks
版面费 US$2836
偏重研究方向 Medicine-Pharmacology (medical)
期刊官网 https://www.dovepress.com/infection-and-drug-resistance-journal
投稿链接 https://www.dovepress.com/submit_step_1.php

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WOS期刊SCI分区是指SCI官方(Web of Science)为每个学科内的期刊按照IF数值排 序,将期刊按照四等分的方法划分的Q1-Q4等级,Q1代表质量最高,即常说的1区期刊。
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关于2019年中科院分区升级版(试行)

分区表升级版(试行)旨在解决期刊学科体系划分与学科发展以及融合趋势的不相容问题。由于学科交叉在当代科研活动的趋势愈发显著,学科体系构建容易引发争议。为了打破学科体系给期刊评价带来的桎梏,“升级版方案”首先构建了论文层级的主题体系,然后分别计算每篇论文在所属主题的影响力,最后汇总各期刊每篇论文分值,得到“期刊超越指数”,作为分区依据。

分区表升级版(试行)的优势:一是论文层级的主题体系既能体现学科交叉特点,又可以精准揭示期刊载文的多学科性;二是采用“期刊超越指数”替代影响因子指标,解决了影响因子数学性质缺陷对评价结果的干扰。整体而言,分区表升级版(试行)突破了期刊评价中学科体系构建、评价指标选择等瓶颈问题,能够更为全面地揭示学术期刊的影响力,为科研评价“去四唯”提供解决思路。相关研究成果经过国际同行的认可,已经发表在科学计量学领域国际重要期刊。

《2019年中国科学院文献情报中心期刊分区表升级版(试行)》首次将社会科学引文数据库(SSCI)期刊纳入到分区评估中。升级版分区表(试行)设置了包括自然科学和社会科学在内的18个大类学科。基础版和升级版(试行)将过渡共存三年时间,推测在此期间各大高校和科研院所仍可能会以基础版为考核参考标准。 提示:中科院分区官方微信公众号“fenqubiao”仅提供基础版数据查询,暂无升级版数据,请注意区分。

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